從受精卵到完整的人體，我們的四肢是如何發(fā)育的？科學(xué)家利用單細(xì)胞技術(shù)找到了一些線索。1月7日，記者從中山大學(xué)獲悉，該校中山醫(yī)學(xué)院張宏波教授課題組發(fā)布了人類(lèi)肢體發(fā)育單細(xì)胞時(shí)空?qǐng)D譜，解析了胎兒四肢的細(xì)胞演變路徑和細(xì)胞空間位置決定過(guò)程。相關(guān)成果論文刊發(fā)于《自然》。
肢體建成的時(shí)空調(diào)節(jié)機(jī)制是一個(gè)經(jīng)典的發(fā)育生物學(xué)難題。張宏波舉例說(shuō)：“把雞胚胎里形成前肢的細(xì)胞團(tuán)切下，移植到背部，竟然能夠長(zhǎng)出完整的翅膀。去除成年蠑螈的腿，它能夠很快再生，即使在切除8到10次之后，依然能長(zhǎng)出新的腿，且?guī)缀蹩床怀鰝?。然而，包括人在?nèi)，大多數(shù)哺乳動(dòng)物卻在進(jìn)化過(guò)程中喪失了這種成年后的再生能力?！?/span>
在細(xì)胞命運(yùn)決定這個(gè)問(wèn)題上，過(guò)去，科學(xué)家往往只能追蹤某一種細(xì)胞的發(fā)育路徑，多同時(shí)追蹤兩到三種細(xì)胞的發(fā)育路徑，無(wú)法看到所有細(xì)胞的命運(yùn)是如何演化的。而對(duì)于細(xì)胞的空間位置決定，科學(xué)家通過(guò)對(duì)胚胎做切片，進(jìn)行單一或少數(shù)細(xì)胞染色，了解到的基因數(shù)量十分有限。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)和單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的發(fā)展，使得探秘細(xì)胞演化過(guò)程成為可能。
張宏波研究團(tuán)隊(duì)從第五周初到第九周胚胎連續(xù)取樣，獲得超過(guò)10萬(wàn)個(gè)細(xì)胞，每個(gè)細(xì)胞約2000個(gè)基因，通過(guò)計(jì)算分析，團(tuán)隊(duì)率先構(gòu)建起精細(xì)的、包含所有細(xì)胞類(lèi)型的人類(lèi)四肢發(fā)育單細(xì)胞圖譜。通過(guò)團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具——DEAPLOG，他們還能夠更好地找到每一個(gè)細(xì)胞的特征，尋找到關(guān)鍵基因，并將這些基因錨定到細(xì)胞演變的路徑上。有了這些信息，團(tuán)隊(duì)能夠進(jìn)一步通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證哪些基因?qū)е铝思?xì)胞命運(yùn)的歧化。
論文共同第一作者、張宏波團(tuán)隊(duì)博士后張寶介紹，利用這一圖譜，能夠直觀地追蹤特定時(shí)間和區(qū)域產(chǎn)生的細(xì)胞類(lèi)型，鑒定到全新的細(xì)胞類(lèi)型，并且可以刻畫(huà)不同種類(lèi)細(xì)胞激活的關(guān)鍵基因。
“當(dāng)這些基因的表達(dá)不遵循既定模式，而又行使關(guān)鍵調(diào)控作用時(shí)，就可能導(dǎo)致特殊的發(fā)育表型，比如短指和多指等發(fā)育異常的現(xiàn)象?！睆垖氄f(shuō)。
