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云計(jì)算如何與基因檢測(cè)成為“黃金搭檔”

文章來源:醫(yī)谷發(fā)布日期:2015-10-21瀏覽次數(shù):7045

         隨著基因產(chǎn)業(yè)的迅速發(fā)展,云計(jì)算正在成為基因公司的“寵兒”。越來越多的基因公司開始利用云計(jì)算平臺(tái)的高吞吐能力降低海量基因、健康數(shù)據(jù)分析的成本。剛剛結(jié)束的國內(nèi)規(guī)模大的云計(jì)算行業(yè)峰會(huì)——2015云棲大會(huì),便成為了基因公司爭(zhēng)相展示創(chuàng)新能力的重要舞臺(tái)。 
         深圳華大基因、北京聚道科技、一脈基因等多家基因公司都在此次大會(huì)上展示了新的產(chǎn)品和技術(shù),隨著下一代基因測(cè)序、生物質(zhì)譜和醫(yī)學(xué)成像等醫(yī)學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展,大數(shù)據(jù)浪潮為生物醫(yī)學(xué)帶來了前所未有的機(jī)遇,將根本性的改變生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究和醫(yī)療實(shí)踐,但同時(shí)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域數(shù)據(jù)爆炸式的增長(zhǎng)也對(duì)海量數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和分析提出新的挑戰(zhàn)。處理這些數(shù)據(jù)需要大量的計(jì)算資源、大規(guī)模的存儲(chǔ)、高效的數(shù)據(jù)傳輸、安全穩(wěn)定的運(yùn)算環(huán)境,而云計(jì)算的出現(xiàn)則很好地解決了這些問題。 
         近年來,特別是今年以來,阿里云在基因領(lǐng)域頻頻發(fā)力,讓業(yè)界側(cè)目。業(yè)內(nèi)專家介紹,阿里云強(qiáng)大的批量計(jì)算能力,為生物和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域帶來了全新的基因數(shù)據(jù)分析體驗(yàn)。用戶不再需要購買硬件,安裝配置軟件和掌握編程知識(shí),可以從繁瑣的IT設(shè)施和數(shù)據(jù)操作中解放開來,只需要專注科學(xué)本身。 
         阿里云專家林河山說:“結(jié)合阿里云對(duì)象存儲(chǔ),批量計(jì)算服務(wù)能夠幫助生物信息分析專家在云上快速構(gòu)建大規(guī)?;蚪M學(xué)應(yīng)用。用戶將更便捷、更簡(jiǎn)單、更迅速完成基因大數(shù)據(jù)計(jì)算,大大降低成本。同樣,因?yàn)樵朴?jì)算的賦能,研究人員開展大規(guī)模的基因組學(xué)研究打開了“方便之門”,這將催生一批影響人類健康相關(guān)的變革性成果。” 
         談及云計(jì)算給基因領(lǐng)域帶來的變革影響,在此次云棲大會(huì)的基因?qū)?chǎng)分論壇上,聚道科技CEO李廈戎說道:“我們目前面向基因領(lǐng)域能夠提供一套云計(jì)算方案,包括傳輸、存儲(chǔ)、計(jì)算以及后續(xù)的分析。例如,我們的一個(gè)客戶通過在全國范圍內(nèi)搜集各種各樣的傳染病原數(shù)據(jù),判斷某種傳染病原由哪種致病微生物引起。這就需要數(shù)據(jù)處理能力能支持不同地區(qū)協(xié)同使用,一旦在某個(gè)地區(qū)發(fā)現(xiàn)感染人群,通過檢驗(yàn)、基因測(cè)序就知道所感染的微生物種屬。我們提供云端服務(wù),幫助他們快速解讀微生物的基因組信息,迅速采取對(duì)應(yīng)方案,控制措施。在個(gè)人健康問題方面,大數(shù)據(jù)和云計(jì)算能有利于基因遺傳性的分析,助力遺傳病研究,預(yù)測(cè)后代患病幾率,提供生育醫(yī)學(xué)建議。” 
         人類的一套基因組包含30億對(duì)堿基,能夠編碼功能蛋白的基因數(shù)量在3萬左右,但這僅占整個(gè)基因組區(qū)域的3%,基因組上超過90%區(qū)域功能人類還是未知的。對(duì)于生命的解讀不僅需要生命科學(xué)領(lǐng)域的不斷創(chuàng)新,更需要計(jì)算領(lǐng)域的支持和參與。一脈基因創(chuàng)始人郝向穩(wěn)表示:“十年前,業(yè)內(nèi)開始搜集大量的人群數(shù)據(jù),探究基因與疾病的關(guān)系,一旦了解某種病跟某種基因的關(guān)系,就可以從基因水平提高診斷的準(zhǔn)確性,做到用藥。此外,基因數(shù)據(jù)結(jié)合心率、血壓、血糖甚至醫(yī)學(xué)項(xiàng)目數(shù)據(jù),才能正確地評(píng)判個(gè)體的健康狀況。一脈基因的定位主要是做人的基因組數(shù)據(jù)分析、存儲(chǔ)、解讀,以及相關(guān)健康產(chǎn)品的開發(fā)。我們?cè)谧鲞@個(gè)事情的過程當(dāng)中,逐漸認(rèn)識(shí)到利用云計(jì)算不僅可以前期減少投資,同時(shí)也避免購買服務(wù)器所產(chǎn)生的折舊損失。”
未來十年內(nèi)大數(shù)據(jù)與人工智能將會(huì)改變幾乎每一個(gè)行業(yè),尤其是醫(yī)療,云計(jì)算與人工智能的結(jié)合將對(duì)基因數(shù)據(jù)進(jìn)行更為深入的挖掘。對(duì)此,華大基因互聯(lián)網(wǎng)發(fā)展中心總監(jiān)官鑫做了進(jìn)一步的解釋:“基因及其研究,本身就與大眾關(guān)系密切,而且需要巨大數(shù)據(jù)量才能解決問題、得到結(jié)果。當(dāng)大數(shù)據(jù)和人工智能應(yīng)用到基因行業(yè)時(shí),能讓基因行業(yè)從傳統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)科學(xué)走上一個(gè)快速突破的道路。現(xiàn)在我們對(duì)于很多復(fù)雜疾病的了解,包括人的表情與基因數(shù)據(jù)的關(guān)系,都需要很多的樣本量去做驗(yàn)證,甚至需要機(jī)器學(xué)習(xí)完成。如果有這樣的大數(shù)據(jù)技術(shù)和云計(jì)算,包括人工智能介入,可以做出很多成果和開發(fā)出很多產(chǎn)品。”
雖然基因測(cè)序已經(jīng)開始影響并滲透我們的生活,但在大眾的印象里,基因測(cè)序更多的還是傾向于“高大上”的健康消費(fèi),不是一般民眾可以支付,那政府需要做一些什么工作來鼓勵(lì)基因行業(yè)企業(yè)走向“大眾化”。
李夏戎認(rèn)為:政府目前能做的事情,是認(rèn)真做好數(shù)據(jù)安全性的標(biāo)準(zhǔn)問題,在這個(gè)方面,美國做得比較好,其無論在醫(yī)療數(shù)據(jù)還是個(gè)人有關(guān)數(shù)據(jù)方面,都有一系列的標(biāo)準(zhǔn)保證它如何存儲(chǔ)、傳輸,同時(shí)包括正確處理個(gè)人隱私方面的問題,而在我國,數(shù)據(jù)安全性還是一個(gè)比較模糊的概念,同時(shí),每個(gè)人擁有兩萬多個(gè)基因,檢測(cè)關(guān)注度會(huì)不一樣,采用的技術(shù)、芯片也各不相同,因此目前基因檢測(cè)也呈現(xiàn)良莠不齊的情況,由此導(dǎo)致了行業(yè)的混亂,并終致使基因公司成本比較高,若我國能制定一套系統(tǒng)的數(shù)據(jù)安全行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),將有效促進(jìn)企業(yè)成本的降低,從而使得基因測(cè)序?qū)?huì)成為大眾的共享。
又快到一年一度全民狂歡的淘寶“雙11”了,前段時(shí)間,醫(yī)谷曾報(bào)道天貓醫(yī)藥館聯(lián)合聚劃算同全國7大精子庫推出捐精在線預(yù)約“聚劃算”,一旦捐精成功,可以獲得3000-5000元的捐精補(bǔ)助,此外還有各大精子庫的的福利套餐,其中包括699元的親子鑒定、199元的酒精代謝基因檢測(cè),如此實(shí)惠的基因檢測(cè)引來了一大幫男筒子的熱烈響應(yīng),華大基因、聚道科技、一脈基因也表示有想法在淘寶天貓進(jìn)行推廣產(chǎn)品,因?yàn)樘詫毷欠浅:玫碾娚掏茝V渠道,但是不能把它當(dāng)做的銷售渠道和的目的,且在流程服務(wù)方面也要非常謹(jǐn)慎,做到讓基因檢測(cè)既普及的同時(shí)又普惠了大眾。