細胞中含有成千上萬的信使RNA分子,它們負責攜帶DNA的復制遺傳指令,通過轉移到其他細胞進而完成細胞間的信息交流。麻省理工學院的工程師們已經開發(fā)出一種RNA分子可視化方案,幫助研究者們以更高的分辨率在完整組織中了解RNA分子,甚至能夠精確定位RNA在細胞中的位置。
該項新技術的關鍵步驟是在組織成像前進行組織擴大。通過將組織自身體積擴大,就可以應用普通的高分辨率成像顯微鏡找到RNA。
“現在我們可以依托細胞的膨脹過程了解RNA的空間精度,甚至我們可以很容易地在大型完整組織中找到RNA,”Ed Boyden 表示,他是麻省理工學院大腦與認知科學系生物工程學副教授,該研究相關文章發(fā)表于2016年出版的《自然方法》( Nature Methods)雜志上。
研究細胞內RNA的分布可以幫助科學家們了解細胞對基因表達的控制機制,也可以幫助專家們調查一些由RNA引起的疾病的病因,找出可行的治療方案。
Boyden 和他的同事們描述了這種底層技術,即顯微鏡(ExM)擴張技術,去年,他們已成功應用該技術形容了大樣本腦組織中的蛋白質物質。該技術相關文章發(fā)表于7月4日出版的《自然·生物技術》(Nature Biotechnology )雜志上的一篇文章中,研究表明,麻省理工學院的研究團隊目前已經提出了一個新版本的技術方案,采用現有的化學物質,更加方便研究者們使用。
一個簡單的過程
在初的擴張顯微鏡技術中,嵌入組織樣本中使聚合物膨脹的物質是水。這就幫助研究者們將目的組織擴大了,研究者們可以在70納米的分辨率下獲得RNA圖像,但這顯然不具有極大的普遍性,因為,只有通過非常專業(yè)并且十分昂貴的顯微鏡才能觀察到。然而,該方法顯然面臨著一系列的挑戰(zhàn),因為它需要一個復雜的化學標記過程,應用抗體標記目標蛋白質后,再與熒光染料以及化學錨連接,其中包含著聚丙烯酸吸水性聚合物,即聚丙烯酸酯的復雜吸水過程。
在此基礎上,通過一些列的方法改良后,終于成功掃描了一塊500 * 500,高度為200微米的組織樣本,得到了一張熒光顯微鏡。研究人員表明,這種技術可以應用于許多類型的組織研究中,包括大腦、胰腺、肺、脾。 RNA成像
在文章中,研究人員使用相同的錨定手段,但發(fā)揮的并不是修飾作用,而是起到對RNA分子的定位效果。使得所有的RNA樣品固定在凝膠中,所以,此時,RNA分子就不得不停留在了原來的位置上,接受整個消化和擴張過程。
空間精度的增強可以讓科學家去探索許多關于RNA的問題,還有助于細胞功能的探究。例如,這有助于神經科學研究者們解決他們面臨的一項長期的問題:在大腦儲存新的記憶或技能時,神經元是如何迅速改變其連接強度的?一種假設是:具有編碼蛋白質功能的RNA分子存儲在細胞間的突觸中,在需要的時候就會被立即翻譯成蛋白質,完成這一過程。因此,該技術為進一步的細胞機制研究提供了技術保障。