8000種腫瘤樣本！全球首份癌癥病例圖譜發(fā)布

近日，《科學(xué)》雜志刊登了瑞典科學(xué)家的重要成果——全球首份癌癥病例圖譜“Atlas”，該圖譜將數(shù)千種特定癌癥相關(guān)基因與患者生存情況聯(lián)系起來，發(fā)掘出32種不以癌癥類型分類、但與80%人類癌癥相關(guān)的“公共”基因，可作為潛在新藥研發(fā)的靶點(diǎn)。 同時，這一成果將有助于醫(yī)生對未來癌癥治療的預(yù)測：通過現(xiàn)有的數(shù)據(jù)，基因組范圍內(nèi)的個人代謝模型得以建立，研究人員可以借此預(yù)測腫瘤的發(fā)展，并提出有針對性的治療方案，改善患者預(yù)后，延長患者的生存時間。因此，該圖譜被認(rèn)為是腫瘤臨床實(shí)踐革命性改進(jìn)的重要推手，據(jù)悉，Atlas圖譜數(shù)據(jù)免費(fèi)向公眾開放（www.proteinatlas.org/pathology ），共享將為其他研究者提供更多參考數(shù)據(jù)。 另悉，Atlas項(xiàng)目的是來自瑞典皇家理工學(xué)院教授馬瑟爾斯·阿合雷，同時任職歐洲生物技術(shù)聯(lián)合會主席，其帶領(lǐng)科研團(tuán)隊使用超級計算機(jī)，分析了8000種腫瘤樣本中的17種主要類型的人類癌癥，并使用RNA測序方法，了解基因在受癌癥影響時發(fā)生的變化，積極尋求”基因突變導(dǎo)致的基因組整體變化。

研究人員確定了2000多個抑制腫瘤生長的基因，但絕大多數(shù)基因靶向藥物會同步產(chǎn)生強(qiáng)烈的副作用。經(jīng)篩選，發(fā)現(xiàn)其中32種基因存在于超過80%的腫瘤樣本中，且與癌癥具體類型無關(guān)，它們可以作為新藥研發(fā)的靶子。 此外，依據(jù)腫瘤類型和腫瘤位置，研究人員還發(fā)現(xiàn)，超過2000種基因?qū)Σ∪松媛实取邦A(yù)后”有著不同的影響，他們還進(jìn)一步將這些“預(yù)后”基因分為“有利于預(yù)后”和“不利于預(yù)后”兩類，而以往對”預(yù)后“基因的研究屈指可數(shù)。 馬瑟爾斯·阿合雷表示：試驗(yàn)結(jié)果表明，大部分癌癥蛋白質(zhì)編碼基因的表達(dá)是有差異的，并且在許多情況下，對患者的存活率產(chǎn)生了很大影響，據(jù)系統(tǒng)生物學(xué)分析顯示，特定癌癥中個體腫瘤的基因表達(dá)差異很大，可能超過不同癌癥類型之間觀察到的變化，然而臨床結(jié)局所需的一般預(yù)后基因不適用于所有癌癥，而Atlas圖譜中的數(shù)據(jù)使我們能夠?yàn)榘┌Y患者生成個性化的基因組代謝模型，以確定參與腫瘤生長的關(guān)鍵基因。此外，我們還探索了與腫瘤細(xì)胞去分化相關(guān)的組織特異性基因，以及特定癌癥抗原在全基因組范圍內(nèi)的作用。 大部分學(xué)者對Atlas圖譜都做出了較高的評價，認(rèn)為該圖譜可以推動臨床醫(yī)療，特別是其中基因部分的知識，對于藥物和廣譜藥物的研發(fā)都至關(guān)重要；另外，該圖譜還可以讓醫(yī)生嘗試性針對病人的臨床數(shù)據(jù)，做出用藥或手術(shù)的干預(yù)方案，而關(guān)于生存期的知識則可以讓醫(yī)生對不同患者給出個體化生活方式的指導(dǎo)。 然而，個別學(xué)者對圖譜持審慎態(tài)度，認(rèn)為該圖譜并不能給醫(yī)生一個明確的答案。