“計算機輔助藥物篩選平臺”正式開放 加快藥物研發(fā)速度

         由北京市計算中心開發(fā)的“計算機輔助藥物篩選平臺”，近日正式開放。該平臺運用虛擬藥物篩選技術，提供蛋白質靶向小分子化合物的篩選和優(yōu)化服務，有望使該類藥物的早期研發(fā)時間縮短一半。 
         “這是我國家商業(yè)化的虛擬藥物篩選平臺，可以通過互聯(lián)網向國內外藥物研發(fā)科研院所和企業(yè)提供遠程服務。”主持平臺研發(fā)的北京市“海聚工程”人才趙勇博士告訴記者。 
         趙勇介紹，小分子化合物類藥物是現(xiàn)代藥物大家庭中占比大的一類。通過和人體內導致疾病的蛋白質發(fā)生作用來發(fā)揮療效。“蛋白質的三維結構就像一套房子一樣有不同的‘房間’，如果導致疾病的‘房間’被小分子化合物堵住，它的功能就停止，疾病就得到治療”。 
         “利用這一特性，我們可以在計算機中建立小分子化合物和蛋白質的三維模型，并利用相關軟件進行二者的模擬對接，終篩選出可能調節(jié)蛋白質功能的小分子化合物。”趙勇說，這樣就可以把藥物篩選工作交給計算機來做。 
         趙勇告訴記者，“計算機輔助藥物篩選平臺”依托運算能力達每秒200萬億次的超算集群，10萬個小分子化合物和一種蛋白質上某個“房間”的對接工作快1個小時便可完成，費用也只有5000元左右。“傳統(tǒng)實驗篩選的命中率只有十萬分之一到萬分之一，虛擬藥物篩選的命中率在2%在40%之間，是實驗篩選命中率200倍以上”。 
         趙勇說，早期藥物研發(fā)一般需要三到五年時間，借助虛擬篩選平臺有望縮短到兩年以內。