本研究中,研究數(shù)據(jù)顯示,在92%的病例中,基因組改變差異不大,而在轉(zhuǎn)錄組水平上則觀察到差異。通過分離固有和獲得性耐藥性,研究人員發(fā)現(xiàn)肝細胞和髓系細胞浸潤分別導致38.5%和23.1%的獲得性耐藥性。重要的是,SMAD4突變和chr20q拷貝數(shù)增加與固有化療耐藥性相關?;蚋蓴_實驗表明,SMAD4R361H/C突變通過STAT3信號通路賦予BVZ和5-氟尿嘧啶(5-FU)耐藥性。值得注意的是,將BVZ和5-FU與STAT3抑制劑GB201聯(lián)合使用可恢復SMAD4R361H/C癌細胞的治療效果。本研究揭示了CRLM及其微環(huán)境在治療過程中的進化動態(tài),并提供了克服藥物耐藥性的策略。
背景信息 01
結直腸癌肝轉(zhuǎn)移(CRLM)約占結直腸癌(CRC)相關死亡病例的70%。2004年,F(xiàn)DA批準貝伐珠單抗BVZ與化療藥物聯(lián)合用于治療轉(zhuǎn)移性結直腸癌(mCRC)。自那時起,其應用范圍已擴展至多種治療方案,包括一線和交叉線治療、輔助治療和維持治療?;贐VZ的化療(BVZ-C療法)目前被作為結直腸癌和CRLM的一線首治療。盡管取得了這些進展,但約50%的CRLM患者對治療無反應,許多受益的患者會迅速復發(fā)。在CRLM患者中確定BVZ-C療法響應者的預測生物標志物迫在眉睫,以優(yōu)化治療決策。 外顯子和轉(zhuǎn)錄組測序技術極大地改變了我們對結直腸癌及其轉(zhuǎn)移的理解。研究人員建立了結直腸癌及其轉(zhuǎn)移癌的全面基因組圖譜。隨后基于表達的分析將結直腸癌分為四個共識分子亞型(CMS),具有獨特的特征。研究人員進一步拓展了我們對中國患者的認識,將腫瘤基因組異質(zhì)性與不同的臨床特征聯(lián)系起來。然而,由于這些研究中缺乏治療數(shù)據(jù),因此與治療反應相關的臨床和分子特征仍不為人所知。 研究人員對接受BVZ-C治療的結直腸癌患者進行了低覆蓋率全基因組測序,并發(fā)現(xiàn)了染色體不穩(wěn)定性在治療結果中的作用。然而,尚不清楚腫瘤細胞是如何在治療過程中進化成耐藥的。此外,藥物耐藥性不能完全用遺傳因素來解釋。據(jù)報道,BVZ耐藥性與血管生成信號通路的冗余、血管共生和纖維母細胞和髓系細胞的浸潤增加密切相關。描述BVZ-C治療后腫瘤及其微環(huán)境(TME)的演變對于理解藥物耐藥機制至關重要。
肝細胞與腫瘤之間的空間鄰近關系導致了獲得性耐藥 02 為了揭示IR和AR如何限制治療效果的分子機制,研究人員開發(fā)了一種稱為SRFS(基于樣本的響應特征選擇)的生物標志物檢測方法,以解析AR和IR的貢獻因素。在對DNA和RNA特征的綜合列表上應用SRFS后,研究人員確定了107個與AR相關的特征。研究人員觀察到,所有基因組特征(包括突變、拷貝數(shù)改變(CNAs)、倍性、突變負荷和CNH)均與AR無相關性。相反,研究人員發(fā)現(xiàn)AR主要依賴于轉(zhuǎn)錄組特征。鑒于這些基因在隊列中的表達水平與AR之間存在強相關性,研究人員測試了這些基因在先前發(fā)表的兩例接受奧沙利鉑+BVZ治療的CRLM患者中的表達情況。一致的是,在疾病進展的患者中觀察到了耐藥相關基因的上調(diào),而對治療有反應的患者則表現(xiàn)出相反的趨勢,這表明這些耐藥相關基因?qū)τ谀[瘤進展很重要。
研究人員發(fā)現(xiàn),肝細胞和髓系細胞的浸潤分別導致了38.5%和23.1%的AR,這指出了肝細胞和髓系微環(huán)境可能促進耐藥的作用。對CRLM患者的轉(zhuǎn)錄組空間數(shù)據(jù)集的分析也揭示了XELOX治療后肝細胞浸潤的增加和肝細胞與腫瘤細胞之間距離的減小。尤其是,先前的研究證實,與不良BVZ-C反應密切相關的替代病理學生長模式(RHGP),在隊列中,AR與腫瘤和肝細胞的空間組織之間存在關聯(lián)。為了闡明這一關系,研究人員將CRLM分為三種不同的病理學生長模式(HGPs):致密型HGP(DHGP)、推進型HGP(PHGP)和RHGP,這對應于兩者之間空間距離的逐漸減小。研究人員利用蘇木精-伊紅(HE)染色對CRLM樣本中的三個HGP進行了定量分析,結果顯示,治療組SD/PD樣本中的RHGP模式較基線增加,而DHGP和PHGP模式未見變化。相反,治療后PR組在RHGP模式上與基線對照組無差異。通過多重免疫熒光(mIF)染色在圖1E中對一些樣本進行了檢查,發(fā)現(xiàn)發(fā)展為AR的樣本中腫瘤細胞與肝細胞之間的距離縮短。對比增強計算機斷層掃描(CT)圖像的評估也顯示,疾病進展腫瘤中RHGP的比例高于疾病響應腫瘤。此外,mIF染色證實,與響應基線水平相比,疾病進展腫瘤周圍CD14+(單核細胞標記)和CD163+(巨噬細胞標記)細胞的比例增加??傊?,本數(shù)據(jù)表明,腫瘤與肝細胞的距離以及升高的髓系細胞豐度可能是BVZ-C療法誘導AR的潛在機制。
結論 03
在這項研究中,研究人員發(fā)現(xiàn)肝細胞-腫瘤空間鄰近和增加的髓系細胞浸潤是CRLMs對BVZ-C療法產(chǎn)生耐藥的主要原因。尤其是,研究人員證明SMAD4R361H/C是一種遺傳標記,為CRC的一線治療提供了分層基礎和治療靶點,預計GB201聯(lián)合療法可以逆轉(zhuǎn)BVZ-C治療的抗藥性