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ChIP揭示糖皮質(zhì)激素和TET2共調(diào)控促進(jìn)癌癥轉(zhuǎn)移的表觀遺傳

文章來源:健康界發(fā)布日期:2024-12-23瀏覽次數(shù):1

結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是全球范圍內(nèi)致死率極高的癌癥之一,尤其是晚期患者。盡管手術(shù)切除是CRC的主要治療手段,但腫瘤轉(zhuǎn)移仍是影響患者長期生存的關(guān)鍵難題,而化療對(duì)于提高生存率的效果有限。

糖皮質(zhì)激素(Glucocorticoids,GCs)通常用于緩解化療引起的嚴(yán)重副作用,然而,有證據(jù)顯示GCs可能削弱化療藥物的效果,并可能加速疾病進(jìn)展。

目前,關(guān)于GCs如何影響化療效果和促進(jìn)腫瘤發(fā)展的分子機(jī)制尚不完全清楚,而揭示這些機(jī)制對(duì)于深化我們對(duì)癌癥治療中GCs作用的理解及可能的改進(jìn)至關(guān)重要。

 先前的研究發(fā)現(xiàn)糖皮質(zhì)激素受體(glucocorticoid receptor,GR)與胸腺嘧啶-DNA糖基化酶(TETs)之間存在相互作用,并提出了GR與TETs酶相互作用的假設(shè)。

該發(fā)現(xiàn)可以為理解GCs在癌癥治療中的作用提供新的視角,并可能為改善癌癥患者的GC治療策略提供科學(xué)依據(jù)。 

利用共免疫沉淀(Co-IP)、染色質(zhì)免疫沉淀測序(ChIP-seq)、Western blot、藥物再定位等實(shí)驗(yàn)揭示了GCs通過與GR和TET2共調(diào)控促進(jìn)CRC轉(zhuǎn)移中的分子機(jī)制,并探索可能的治療策略。

研究對(duì)HEK293T細(xì)胞使用GR和TET家族蛋白(TET1、TET2、TET3)抗體進(jìn)行共免疫沉淀(Co-IP)和染色質(zhì)免疫沉淀測序(ChIP-seq);通過Connectivity Map數(shù)據(jù)庫,利用HEK293和HCT116細(xì)胞系中GR和TET2的共有靶基因以及CRC差異表達(dá)基因(DEGs)進(jìn)行藥物再定位;在表達(dá)GR水平不同的CRC細(xì)胞系(即HCT116和HT29細(xì)胞系)中進(jìn)行細(xì)胞遷移和侵襲實(shí)驗(yàn),地塞米松(Dex)處理導(dǎo)致兩個(gè)表達(dá)GR水平不同的CRC細(xì)胞系的細(xì)胞遷移率出現(xiàn)差異。Co-IP和ChIP-seq分析驗(yàn)證了HEK293T細(xì)胞中GR和TET家族蛋白之間的互作。所選化合物Belinostat成功驗(yàn)證了其抗GC誘導(dǎo)的CRC細(xì)胞侵襲潛力。

對(duì)Belinostat處理的HCT116細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析揭示了與癌癥轉(zhuǎn)移相關(guān)的靶基因下調(diào)。 本研究研究為理解GC誘導(dǎo)轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制提供了寶貴的見解,引入了可能作為GC治療潛在輔助療法的新定位化合物。此外,本研究為探索CRC治療的新藥候選物指明了方向。 

研究亮點(diǎn): 對(duì)結(jié)直腸癌(CRC)細(xì)胞中糖皮質(zhì)激素誘導(dǎo)轉(zhuǎn)移效應(yīng)的機(jī)制研究表明,在糖皮質(zhì)激素(GC)暴露后,不同糖皮質(zhì)激素受體(GR)表達(dá)水平的CRC細(xì)胞遷移率變化。GR與TETs酶互作將糖皮質(zhì)激素信號(hào)和表觀遺傳調(diào)控相關(guān)聯(lián)。用belinostat共靶向GR和TET導(dǎo)致與轉(zhuǎn)移相關(guān)基因下調(diào),為糖皮質(zhì)激素與癌癥之間的關(guān)系提供新見解。

 研究摘要 研究方法 細(xì)胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染:對(duì)HT29和HCT116細(xì)胞系進(jìn)行實(shí)驗(yàn),通過脂質(zhì)體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染方法過表達(dá)TET3和GR。 Western blot分析:檢測蛋白表達(dá)水平。

 細(xì)胞遷移和侵襲實(shí)驗(yàn):評(píng)估不同GR表達(dá)水平的CRC細(xì)胞系對(duì)地塞米松(Dex)治療的遷移反應(yīng)。 共免疫沉淀(Co-IP):研究GR與TET家族蛋白之間的互作。 RNA-seq和ChIP-seq測序:分析GR和TET蛋白的共有靶基因。

 藥物再定位:利用Connectivity Map數(shù)據(jù)庫,基于GR和TET2共有靶基因進(jìn)行藥物再定位分析。